工程保函是依据商务合同开出的，但又不依附于商务合同，是具有独立法律效力的法律文件。当受益人在保函项下合理索赔时，担保人就必须承担付款责任，而不论申请人是否同意付款，也不管合同履行的实际事实，即保函是独立的承诺并且基本上是单证化的交易业务。
由担保人为施工方向业主提供的，保证施工方履行工程建设合同责任和义务，承包商不履行合同的，业主可要求保证人在保函金额内承担保证责任。保证人在承担保证责任后，可依法向承包商追偿。
银行不同，费用不同，众所周知，大银行，费用肯定高，小银行费用低，具体看甲方对银行有无要求。
开具时间不同，银行都是按照一定的时间节点来收费的，不同的时间节点肯定是不一样的。
预付款保函是指银行对承包人进行担保的一种方式，银行开出符合业务要求的预付款保函后，承包人收到预付款，但并未按照合同执行项条款，未按时供货或者施工，业主这时提供相关证据，可向银行提起索赔，银行有见索即付的义务。
承包人自己可以在银行开付余款保函，看承包人在银行的授信如何，授信好的保证金比例
比较低，授信不好的保证金比例比较高，甚至是全额保证金。
银行保函是指银行应委托人的申请而开立的有担保性质的书面承诺文件，一旦委托人未按其与受益人签订的合同的约定偿还债务或履行约定义务时，由银行履行担保责任。它有以下两个特点：
1.保函依据商务合同开出，但又不依附于商务合同，具有独立法律效力。当受益人在保函项下合理索赔时，担保行就必须承担付款责任，而不论委托人是否同意付款，也不管合同履行的实际事实。即保函是独立的承诺并且基本上是单证化的交易业务。
2.银行信用作为保证，易于为合同双方接受。