转账凭证与收付款凭证的区别在于：
转账凭证，是指用于记录不涉及库存现金和银行存款业务的记账凭证。而收付款凭证，是指用于记录库存现金和银行存款收付款业务的记账凭证。
转账凭证通常是根据有关转账业务的原始凭证填制的。而收付款凭证根据有关库存现金和银行存款收付业务的原始凭证填制，是登记库存现金日记账、银行存款日记账以及有关明细分类账和总分类账等账簿的依据，也是出纳人员收讫、支付款项的依据。
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