北京儿童医院拥有教育部儿科学国家重点学科和教学团队，是首都医科大学儿科医学院和儿科学系所在地，现有教授、副教授116人，承担着本科及博士、硕士研究生、七年制儿科专业，护理大专及继续医学教育等多层次教学任务，并设有博士后流动站，每年为社会输送大量儿科人才。
年来，为方便患者就医，北京儿童医院始终坚持24小时接诊。医院积极践行公立医院改革，推进预约挂号工作，优化服务流程，改善患者就医体验，受到国家卫生健康委的肯定和广大群众的认可。医院还承担了上级部门委派的重大儿童传染病防治、抗震救灾支援、突发公共卫生事件救治等医疗任务。
随着我国人民生活水平的提高，家长对孩子身高的关注度越来越高。矮小的诊断标准：身高低于同地区、同种族、同性别、同年龄身材正常儿童身高平均值两个标准差，或者身高低于该人群儿童身高的第3百分位。导致身材矮小的原因众多，生长缺乏症、家族性矮小、体制性青春期延迟、先天性卵巢发育不全、甲状腺功能减低、性早熟所致的矮小、早产儿、小于胎龄儿、严重的佝偻病和骨骼发育畸形以及多种慢性疾病所致的矮小、特殊矮小综合征等均可引起矮小。另外，特发性的矮小不仅与遗传因素有关，也与不健康的生活方式密切相关。
内分泌科是医院中一个专门内分泌科疾病的地方，主要负责糖尿病、肥胖症、骨质疏松、痛风、脂质代谢紊乱以及甲状腺、垂体、肾上腺、性腺、甲状旁腺等疾病的临床诊治。