会计档案整理是企业档案管理非常重要的一步，企业档案管理者要整理会计档案就要学会如何使用会计档案盒仔细的把会计档案整理装入会计档案盒中按规定分类保存，
会计档案盒使用关键是会计档案整理，会计档案整理的步骤如下：
（一）决算报表
1、按“卷”整理。一册（本）为一卷，编制一个档号，档号构成：全宗号-目录号-案卷号。
2、编页号：以有效内容的页面为一页。单面书写的文件材料在其右上角编写页号，双面书写的文件材料，正面在其右上角，背面在其左上角编写页号。
3、填写会计档案盒的封面及盒脊
（1 ） 全宗名称：全宗名称相当于立档单位的名称，填写时和会计凭证盒正面上的“单位名称”要求一致。
（2）案卷题名：由整理会计档案的人员自拟。案卷题名应准确概括本盒会计档案的形成单位、时间、内容、类别。
（3）起止时间：填写形成本盒会计档案的起止年月日。
（4）卷数、张数：填写本盒内会计档案的总卷数和总张数。
（5 ）保管期限：按照《会计档案保管期限表》填写该盒会计档案的保管期限。
（6）全宗号、目录号
（7）案卷号：填写本盒内会计档案的案卷号或案卷起止号，在案卷起号和止号之间用“一”隔开。
（8）盒号：暂不填。
（9）填写会计档案盒盒脊项目。
4、录入电子文档管理系统
（1）点“档案著录”中的“案卷著录标引” → 点“添加”→ 档案类别“会计档案” →二级类目“财务报告类” →保管期限“” →年度“2016” →题名2016年决算报表” →文件开始时间→文件截止时间→件数（该卷盒内文件份数）→载体数量（后一个页号）→点保存。
（二）会计账簿
1、有页号的可不再另编页号。
2、其他操作与决算报表一样，只是目录号不同。银行存款帐、现金日记账使用同一目录号，案卷号连续编。
3、如果银行存款帐、现金日记账几年记在一个账簿上的，则用完后归档。（多两年使用一册账簿）
4、总账、明细账与银行存款帐、现金日记账操作步骤一样，只是目录号不同。
5、录入电子文档管理系统
步骤同“年度决算报表”，只是二级类目选“会计账簿类”.
（三）会计凭证
1、排列：按年度的先后排列，同一年度内按月份的先后排列。
2、会计凭证的编号：
每本凭证一个档号,全部编完,年度与年度之间拉通编。会计凭证封面有档号的填在档号处，没有档号的填在会计凭证封面左上角空白处。
3、装盒并填写：
编号完成后，按顺序装入会计档案凭证盒，装满一盒再装下一盒。填写会计档案凭证盒封面及盒脊。根据会计凭证封面的有关项目对应填写，填写方法与会计凭证封面一致。
（1）单位名称：填写形成会计档案的单位名称，必须用全称或通用简称。
（2）会计凭证名称：填写能够反映会计凭证用途或内容的名称，如：“收款会计凭证”、“付款会计凭证”、“转账会计凭证”或“基建会计凭证”、“工会会计凭证”、“预算外会计凭证”等。
（3） 时间：填写本盒会计凭证所属年月。
（4） 起止时间：填写本盒会计凭证的起止年月日。
（5） 归档时间：填写单位内财务部门向档案部门移交会计档案的年月。
（6） 立卷人：填写整理本盒会计凭证的人员姓名。
（7） 保管期限：根据财政部和国家档案局1998年颁布的《会计档案保管期限表》确定填写该案卷的保管期限。
（9）全宗号：填写档案馆给立档单位编制的代号。
（10） 目录号：填写全宗内案卷所属目录的编号，在同一个全宗内不允许出现重复的案卷目录号。
（11）案卷号：目录内案卷的顺序编号，在同一个案卷目录（或分类体系的一级类目）内不允许出现重复的案卷号。
（12） 会计凭证盒盒脊填写方法
盒脊项目与正面有关项目对应填写。
4、录入电子文档管理系统
步骤同“年度决算报表”，只是二级类目选“会计凭证类”，并录入凭证起止号。